Os seres vivos de um local não são afetados apenas pelos outros organismos que convivem com ele, mas tambem pelos elementos não-vivos desse ambiente.
Por exemplo, uma lagoa: os peixem que vivem nela dependem, para a sua sobrevivência, da´água e do oxigênio dissolvido na água; as plantas dependem da luz, da água, dos sais minerais, do gás carbônico e do oxigênio para se alimentar; outros seres vivos dependem das plantas e do oxigênio e do ar para sobriviver.
Todos os seres vivos e a parte não-viva de um ambiente (água, minerais do solo, gases dissolvidos, luz, etc...), somados a todas as relações entre esses elementos, formam um ecossistema.
Assim a lagoa é um ecossistema; a afloresta Amazônica e a caatinga são outros exemplos de ecossistemas. Mas tambem são exemplos de certos ambientes muito menores, como uma poça de água na mata ou a água acumulada na cavidade de uma planta
Um ecossistema, portante, é formado pela comunidade e pelo meio ou ambiente físico, incluindo as relações que se estabelecem entre eles.
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